公司可以通过以下步骤来抵发票：
认证发票
将税控盘插入电脑主机，登录增值税综合服务平台，选择需要认证的月份。
勾选需要认证的发票，包括纸质发票和电子发票，然后提交认证申请。
认证通过后，系统会生成认证统计表。
抵扣进项税额
在取得抵扣凭证并符合抵扣条件后，需要在次月申报时在增值税纳税申报表上申报认证通过的进项税额，并从销项税额中抵减。
抵减后的差额作为当期应纳增值税额进行申报。
抄税和报税
税务局一般每月初为抄税期，企业需要将金税卡插入税控机，打开开票软件点击抄税。
打印进项税发票和销售发票清单，进项税发票是从认证通过后打印的，销售发票清单是从税控机中打印的。
根据打印的清单填写各种报表，包括增值税申报表，并将抵扣的发票金额按规定方式列入申报表中，以减免税款。
记账和核算
根据收集到的发票信息，准备相应的记账凭证，借记“应交税金/增值税进项”，贷记“应付账款/应付增值税”。
在记账前，核查发票及相应的记账凭证，确保信息一致且金额正确。
将抵扣的进项税额分门别类体现在相应的抵税科目上，并在报税时填写相应的申报表格。
确认抵扣准则
根据当地税法，了解抵扣政策和规定，确保只有符合特定条件的发票才能用于抵税，例如发票的真实性、合法性，以及是否用于增值税应税项目等。
办理抵税手续
发票申报后，按照表上的金额办理抵税手续，获得相应的税款减免。
通过以上步骤，公司可以完成发票的抵扣，从而降低应纳的增值税额，减轻税务负担。在整个过程中，确保所有操作符合相关税法规定，以保证合法性和合规性。