如果您发现您的手机被恶意软件扣费，您可以采取以下步骤尝试追回费用：
收集证据
确认扣费记录，保存相关的账单和交易信息。
使用手机病毒查杀软件和恶意软件查杀工具检查手机。
联系服务商
拨打手机运营商客服热线（如10086）咨询扣费原因。
若手机运营商有责任，可要求其协助处理退费。
应用内处理
如果是通过某个应用程序扣费，尝试在应用内报告问题并申请退费。
投诉渠道
通过消费者投诉平台（如12315、12363）进行投诉。
访问黑猫投诉网站提交投诉，并提供必要的证据和信息。
法律途径
如果以上步骤均未能解决问题，您可以考虑通过法律途径解决，如向人民法院提起民事诉讼。
预防措施
关闭不必要的应用和服务，避免类似情况再次发生。
定期检查您的手机账单，确保没有未经授权的费用产生。
请记得在进行以上操作时保存好所有相关的沟通记录和交易凭证，这些将作为您维权时的重要依据。